應用(yòng)案例

經過20多(duō)年的發展,寶德(dé)持續而深刻地把握市場需求,積累了海量的客戶資源和豐富的服務(wù)經驗

寶德(dé)助地壇醫(yī)院抗擊埃博拉
案例背景

日前,寶德(dé)在首都醫(yī)科(kē)大學(xué)附屬醫(yī)院北京地壇醫(yī)院(簡稱“地壇醫(yī)院”)埃博拉出血熱病例應急設備采購(gòu)項目中(zhōng)一舉中(zhōng)标,為(wèi)客戶量身定做的包括硬件建設、系統建設、軟件建設與技(jì )術服務(wù)在内的HPC集群解決方案,為(wèi)地壇醫(yī)院在埃博拉病毒檢測以及後期病原檢測方面的研究提供了高計算能(néng)力、高性能(néng)、高存儲的計算平台,加快了地壇醫(yī)院提升埃博拉病毒檢測、病原檢測等生命科(kē)學(xué)科(kē)研水平的步伐。

案例分(fēn)析

地壇醫(yī)院始建于1946年,是北京市衛生局直屬三級甲等醫(yī)院,也是北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部、北京中(zhōng)醫(yī)藥大學(xué)教學(xué)醫(yī)院。國(guó)家肝病、艾滋病臨床藥物(wù)驗證基地、國(guó)家中(zhōng)醫(yī)藥管理(lǐ)局中(zhōng)西醫(yī)結合傳染病臨床基地均設于此。醫(yī)院主要承擔除結核病以外的39種法定傳染病的診治、研究和培訓任務(wù),是一家集醫(yī)療、教學(xué)、科(kē)研、預防為(wèi)一體(tǐ)的公(gōng)共衛生臨床醫(yī)療機構。2014年8月埃博拉病毒肆虐非洲,疫情瞬息萬變。地壇醫(yī)院第一批援幾内亞醫(yī)療隊于8 月12日兩小(xiǎo)時内集結完畢趕赴西非。針對可(kě)能(néng)發生的埃博拉出血熱疫情傳入風險,北京市衛生計生委指定地壇醫(yī)院為(wèi)埃博拉出血熱定點收治醫(yī)院。中(zhōng)國(guó)雖然沒有(yǒu)發現埃博拉病毒患者,但是疑似患者入院治療的情況還是屢有(yǒu)發生。為(wèi)防止埃博拉病毒入侵我國(guó),地壇醫(yī)院啓動了埃博拉出血熱病例應急設備的采購(gòu)。通過對客戶背景與應用(yòng)需求的深入分(fēn)析,結合以往在生物(wù)信息與生命科(kē)學(xué)領域HPC方面的成功案例,寶德(dé)最終為(wèi)客戶确定了基于寶德(dé)生物(wù)一體(tǐ)機PowerScale8000-B高性能(néng)計算機集群系統的解決方案。寶德(dé)PowerScale8000-B是一套應用(yòng)于生物(wù)信息計算的一體(tǐ)機,能(néng)為(wèi)客戶在序列比對、序列拼接、GPU 加速方面提供更的高性能(néng)保證;它使用(yòng)目前業界先進的軟件定義存儲,在安(ān)全、性能(néng)、管理(lǐ)方面能(néng)發揮極緻性能(néng)。

解決方案

寶德(dé)PowerScale8000-B高性能(néng)計算機集群系統
寶德(dé)PowerScale8000-B高性能(néng)計算機集群系統作(zuò)為(wèi)埃博拉病毒檢測以及地壇醫(yī)院後期病原檢測的主要計算單元,配合高通量測序儀一起完成地壇醫(yī)院埃博拉病毒應急設備項目,每次要滿足測序儀>150億(15G)堿基數據的計算,并且每次對>2000 萬個片段序列的數據的分(fēn)析,要滿足98%以上的原始數據的準确性。為(wèi)此,寶德(dé)為(wèi)客戶設計了一套擁有(yǒu)10.49萬億次計算能(néng)力的HPC集群整體(tǐ)解決方案。該方案網絡部分(fēn)采用(yòng)雙網分(fēn)離結構,包括管理(lǐ)網和計算網兩部分(fēn),管理(lǐ)網使用(yòng)一台千兆交換機實現對所有(yǒu)節點的正常管理(lǐ);計算網使用(yòng)超低延遲核心萬兆以太網交換機作(zuò)為(wèi)數據傳輸通路,保證數據的無阻塞、高效快速轉發,以便更快地計算出數據結果。存儲部分(fēn)設計了一套分(fēn)布式的海量存儲系統,整套系統可(kě)提供70TB的可(kě)使用(yòng)空間、800MByete/s的實際使用(yòng)帶寬,以及60萬/s的IOPS 并發訪問數,以保證數據調用(yòng)的暢通無阻。事實上,此次與地壇醫(yī)院的合作(zuò)隻是寶德(dé)HPC解決方案在生命科(kē)學(xué)行業成功應用(yòng)的一個縮影,此前,寶德(dé)與華大基因、中(zhōng)國(guó)科(kē)學(xué)院北京生命科(kē)學(xué)院、中(zhōng)國(guó)疾病監控中(zhōng)心、嘉寶仁和醫(yī)療有(yǒu)限公(gōng)司等行業客戶在生命科(kē)學(xué)研究領域展開了全面合作(zuò),在該領域積累了大量的客戶與行業經驗。其中(zhōng),與華大基因的多(duō)次合作(zuò)更是締造了寶德(dé)高性能(néng)服務(wù)器PowerScale繪制全球第一張“黃種人基因圖譜”、寶德(dé)Power Cluster8000HPC計算機系統繪制大熊貓基因兩座裏程碑。

客戶收益

波士頓咨詢公(gōng)司(BCG)發布的報告顯示,中(zhōng)國(guó)醫(yī)療科(kē)技(jì )市場将在2013 年至2020 期間保持14%的年均增長(cháng)率,到2020 年,市場規模将增至550億美元,成為(wèi)全球第二大醫(yī)療科(kē)技(jì )市場。報告預測,到2020年,中(zhōng)國(guó)醫(yī)療科(kē)技(jì )市場将超越日本和德(dé)國(guó),從2013 年的世界第四位躍升至第二位,占據全球市場份額的13%。目前,國(guó)内醫(yī)療科(kē)研市場HPC應用(yòng)正處于起步階段,許多(duō)國(guó)産(chǎn)服務(wù)器廠商(shāng)在醫(yī)療科(kē)研市場表現乏力,醫(yī)療科(kē)研市場存在大範圍空白。長(cháng)期以來,寶德(dé)一直緻力于國(guó)内HPC的應用(yòng)與普及,憑借在HPC領域的深入研究,寶德(dé)大力開拓醫(yī)療科(kē)研市場,在該領域積累了深厚的經驗,填補了醫(yī)療科(kē)研市場HPC應用(yòng)的空白,并為(wèi)加快我國(guó)醫(yī)療科(kē)研領域的研究成果落地轉化做出了突出的貢獻