解決方案

以客戶為(wèi)中(zhōng)心,提供定制化或一站式的全棧解決方案,賦能(néng)千行百業

寶德(dé)高性能(néng)計算之生命科(kē)學(xué)解決方案
項目背景

多(duō)場景應用(yòng)多(duō)需求:生物(wù)信息學(xué)(序列搜尋比對分(fēn)析)--需要較大的内存容量和内存帶寬, 需要直連架構CPU;分(fēn)子動力學(xué)--對網絡需求比較大,節點間需要使用(yòng)低延時,高帶寬的Infiniband高速網;分(fēn)子對接(藥物(wù)設計)--計算量非常大,消耗計算機時很(hěn)多(duō);測序儀離線(xiàn)處理(lǐ)--内存、存儲容量需求大,作(zuò)業運行需要與作(zuò)業調度系統結合;電(diàn)子顯微鏡圖象處理(lǐ)--軟件内存需求和IO需求較大,計算時間長(cháng),系統穩定性、可(kě)靠性要求高;質(zhì)譜儀原始資料處理(lǐ)--系統計算量大,計算時間長(cháng),系統穩定性,可(kě)靠性要求高。

方案介紹

基于寶德(dé)PowerScale 8000高性能(néng)計算集群是一個有(yǒu)機的、高性能(néng)、高可(kě)靠性的集群系統。系統的硬件都選用(yòng)經過嚴格測試的主流産(chǎn)品,保證系統的可(kě)靠性;互聯系統各組件的網絡都是專用(yòng)的高效網,通過集群核心的管理(lǐ)系統使得整個系統協調一緻的運行,如單獨的一台高性能(néng)計算機一樣為(wèi)用(yòng)戶提供統一的服務(wù)。PowerScale 8000向用(yòng)戶提供一個單一計算機的界面。前置計算機負責與用(yòng)戶交互,并在接受用(yòng)戶提交的計算任務(wù)後通過調度器程序将任務(wù)分(fēn)配給各個計算節點執行;運行結束後通過前置計算機将結果返回給用(yòng)戶。程序運行過程中(zhōng)的進程間通信通過專用(yòng)網絡進行。

方案解析

PowerScale 8000系統共配置10 個雙路八核刀(dāo)片服務(wù)器。刀(dāo)片式集群系統在計算密度、功耗散熱、運營成本、維護成本、可(kě)靠性等方面,都明顯優于其它系統,且為(wèi)系統的擴容升級提供了良好的基礎。計算系統的選擇實現了多(duō)樣化,分(fēn)别配置了最通用(yòng)的雙路八核的刀(dāo)片節點,這樣的配置可(kě)以更好滿足不同應用(yòng)的需求。配置高性能(néng)的光纖 SAN 存儲系統,配置 20TB 磁盤陣列存儲,配置并行文(wén)件系統,實現了多(duō)分(fēn)區(qū)的統一管理(lǐ)和多(duō)通道的并發讀寫。管理(lǐ)網絡采用(yòng)千兆網絡,計算網絡采用(yòng)Infiniband高速網絡互連;主要産(chǎn)品都采用(yòng)了冗餘設計(電(diàn)源、風扇等),存儲系統采用(yòng)雙鏈路冗餘設計,系統的可(kě)靠性有(yǒu)較高保證;對于與測序儀鏈接的服務(wù)器和存儲設備,配置了雙機熱備,保證了系統的可(kě)靠性。寶德(dé)公(gōng)司将為(wèi)用(yòng)戶提供完善的服務(wù),包括安(ān)裝(zhuāng)調試、系統優化、用(yòng)戶培訓等,這些都不單獨收費,用(yòng)戶不必考慮這些方面的費用(yòng)。

方案優勢
  • 系統

    系統協調高效

  • 高性價比

    高性價比且方便後期擴容升級

  • 高可(kě)靠性

    高可(kě)靠性和完善的服務(wù)